Thunderbolts Initiative
Depuis la saga "Civil War", les Nouveaux Thunderbolts sont redevenus des fugitifs recherchés cette fois par le [S.HI.E.L.D.] et l'Initiative. La moitié de l'équipe se fera arrêtée et participera contre son grès à un plan du gouvernement. Le but étant de recréer une équipe reprenant les fonctions de la Freedom Force laissées vacantes depuis la dissolution de Facteur X.
Tout comme pour Freedom Force, le projet est de forcer des super-criminels à bosser pour le gouvernement en échange d'une remise de peine. Cependant depuis la trahison de la Freedom Force, la confiance n'est plus de mise et les membres de cette équipe seront contraints de supporter un dispositif d'obéïssance : bracelet anti-pouvoirs durant les déplacement, nanites de surveillance et implants commandés électrifiant dans la colonne vertébrale. La moitié manquante des Nouveaux Thunderbolts sera remplacée par des criminels d'envergure comme Venom III, le Pitre, le Tireur ou des héros condamnés à de lourdes peines comme Swordman III ou Penance II. Deux membres des Nouveaux Thunderbolts échapperont à ce carcan : Atlas II et Blizzard II par des jeux de bureaucratie pour intégrer l'Initiative suite à la demande de Stark.